1. Campo de dunas livres: maior campo de dunas costeiras das Américas.
2. Restinga: concentra a maior biodiversidade do Parque.
3. Mangues: ocorrem na parte oeste do Parque.
4. Zona Litorânea: 1 km de faixa marinha a partir da praia, com cerca de 70 km de extensão.
5. Largo de Santo Amaro: maior corpo do Parque.
6. Zona Primitiva: área de alta importância e a mais restritiva do PNLM, inclui Queimadas dos Britos e Baixa Grande. Proibido o acesso de veículos.
a. Circuito Lagoa Azul: percurso de 10 km em veículo de 4x4 e caminhada leve nas dunas até as lagoas.
b. Circuito Lagoa Bonita: percurso de 15 km em veículo 4x4 e caminhada nas dunas até lagoas, necessário subir uma duna bastante íngreme, que exige bom preparo físico.
c. Circuito Lagoa da Esperança: lagoa permanente de águas escuras, percurso de 20 km em veículo 4x4 e caminhada leve.
d. Circuito Foz do Rio Negro: a partir do Povoado do Atins, percurso de 20 km em veículo 4x4 pela praia.
e. Circuito Ponta dos Lençóis: caminhada por áreas de restinga, campos e dunas, passando pelos povoados da Ponta do Mangue e Canto Atins.
f. Mandacaru: povoado pesqueiro no entorno do Parque, onde há um farol da Marinha.
g. Caburé: estreita faixa de areia entre o oceano e o Rio Preguiças, no entorno do Parque.
* Consultar o PNLM sobre as condições para a operação dos circuitos de visitação